شرکت مهرسام صنعت دپارتمانی جداگانه جهت مدیریت پروژه‌های مختلف دارد که ترکیبی از مدیران پروژه، کارشناسان خرید، کارشناسان کنترل پروژه و مهندسان مربوطه در این قسمت مشغول به کار هستند. با چنین ترکیبی از نیروها و کمک گرفتن از ابزارهای کنترل پروژه، این دپارتمان می‌تواند تعادل اقتصادی میان عوامل هزینه، زمان و کیفیت را در پروژه‌هایی که مدیریتشان را بر عهده می‌گیرد برقرار کند.